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2021年最新最全“PCR异常曲线”分析!
图:陈众摄 1. PCR正常扩增曲线
随着实验的进行 , 扩增产物不断累积 , 相应的荧光信号也不断在增加 , 每进行一个循环就采集一次荧光的信号 ,经过一定的循环数后(比如 40 个循环),就可以得到下面的扩增曲线图( 横坐标代表扩增的循环数cycle , 纵坐标代表荧光的强度 )。
这其中还需要弄清楚一些基本概念,如:
基线 : 指在 PCR扩增反应的最初的几个循环里,荧光信号变化不大。接近一条直线,该直线叫做基线。 这个了解即可 , 对实验操作没什么影响 。
阈值线 :一般来说,前 15 个循环的荧光信号作为荧光本底信号,阈值的设定就是 3-15个循环荧光信号标准差的 10倍,在 PCR 扩增的指数期(如图中箭头所指)。
说的这么严肃 ,其实 很多仪器 自动设定的阈值线 基本能够满足我们的实验要求 , 不需要我们手动设置的 。
CT值:我们常会用 CT 值来计算我们的相对含量,即扩增产物的荧光信号到达设定的阈值线时所经历的扩增的循环数,也就是图中扩增曲线和阈值线的交汇处的横坐标所显示的值。
2. 标准曲线
做标准曲线有啥用? 标准曲线可以用来确定未知的样品的 初始量。如果是需要 绝对定量 ,是 必须要有标准曲线 什么是期权市场的PCR指标? 的。
怎么做 呢?每个模板的 CT 值与该模板的起始的拷贝数的对数是存在线性关系的,起始的拷贝数越大, CT 值就越小。标准品按照一定的倍数稀释 5- 6 个浓度左右,根据 RT-PCR 的反应条件进行反应。以标准品拷贝数的对数值为横坐标, CT 值为纵坐标,绘制线性曲线。而未知样品的拷贝数即可根据曲线方程计算得来。
那么,问题来了,这个标准曲线的 标准品怎么确定 呢? ( 1 )如果是做绝对定量,标准品的要求比较高,这个的制备过程也相对复杂一些,但结果也更加精确。
要求 : 必须是 准确定量的、标准化的、稳定的 质粒 DNA (也可以是基因组 DNA ,纯化后的 什么是期权市场的PCR指标? PCR 产物等), 5- 6 个稀释梯度 ; PCR反应仪器要同一种,并且同时操作; 反应的条件一致 : 反应体系 、 参数等等 ; 反正能一致的都一致就对了 。
( 2 )如果只是想看看 扩增效率( E ) ( E=10-1/ 斜率),检验 PCR 的反应体系是否符合要求,我们有时候也采用待测试样品作为标准品,逐步稀释后进行反应,最终看标准曲线的斜率和 R 2 是否符合要求,我比较懒,常会用这种方法,不过有些发文章的要求会比较高,那还是要乖乖去做的。
3. 溶解曲线
简单点说,就是考察染料标记法结果的特异性的。再简单点,就是分分钟确定你的引物是否有效。
复杂的原理我就不解释了 , 关键是怎么看和怎么判断 。如果反应产物单一,曲线会出现一个尖峰;如果有二聚体或者非特异性的扩增,就会出现至少两个峰或者更糟糕。采用 什么是期权市场的PCR指标? SYBR Green 染料时是必须要做溶解曲线的,毕竟这是一个非特异性的染料。
在实验中 , 大家还是会碰到很多问题的 ,下面列举几个比较常见的问题:
( 1 )扩增曲线经过 40 个循环后没有平台期?或者扩增曲线根本无法呈现指数上升? 这种情况下很有可能是你的起始模板浓度太低了 什么是期权市场的PCR指标? , 即便经过 40个循环也是达不到平台期的,可以通过增加循环数来验证是否是该问题。
( 2 )溶解曲线的问题:比如多个峰,或者尖峰的前面有个小小的小峰,或者没有峰? 这个跟引物以及反应的体系温度有关系 , 如果说没有峰值或者杂乱无章 , 什么是期权市场的PCR指标? 很有可能是引物的问题 , 建议重新设计引物 。 有时候有小的峰 , 可以通过优化反应条件 , 比如退火温度的优化来消除这个影响 。
常见异常曲线分析:
PCR指标对标的价格趋势前瞻性研究初探
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外泌体RNA提取试剂盒
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产品介绍:
该产品是专门用于血清、血浆、唾液等液体样本中外泌体RNA提取的试剂盒。它采用了最新的优质进口离子膜,裂解液和洗脱液经过多次优化,能高效地分离纯化外泌体RNA。提取得到的外泌体RNA较其它品牌的同类试剂盒产量更大,纯度更高,最大限度地去除了蛋白、色素、脂类等杂质污染,可以直接应用于RT-PCR、Real Time RT-PCR、分子杂交等各种分子生物学实验。
产品特点:
1、操作简便快速,只需20多分钟即可提取外泌体RNA;
2、提取RNA纯度高,无抑制剂,A260/A280为1.8-2.0;
3、产量更高,较国内多家同类产品高出20%。
操作步骤:
1. 请自行准备:无水乙醇、无RNA酶1.5mL离心管。
2. 取出洗涤液,按以下操作:
a) 洗涤液A:21mL加入9mL无水乙醇;42mL加入18mL无水乙醇,混匀。
b) 洗涤液B:9mL加入21mL无水乙醇;18mL加入42mL无水乙醇,混匀。
c) 配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。
3. 取无RNA酶的1.5mL离心管,加入200μL外泌体样本,再加入200μL 裂解液及20μL 消化液,漩涡震荡10秒,充分混匀,65℃水浴10 分钟。
4. 加入0.9mL无水乙醇,轻轻颠倒混匀,如有半透明悬浮物,不影响RNA的提取与后续实验。
5. 将吸附柱放入收集管内,将700μL上述溶液转入吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液;将剩余溶液转移至吸附柱内,12,000 什么是期权市场的PCR指标? rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。
6. 将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液A至吸附柱内,静置2分钟,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。
7. 将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液B至吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。
8. 按每份样本40μL 取洗脱液(如10份提取样本,即取400μL 洗脱液),放置于灭菌1.5mL离心管,65℃预热。
9. 将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 4℃离心2 分钟,离去残留的洗涤液。
10. 取出吸附柱,放入新的无RNA酶的1.5 mL 离心管内,加入上述预热的40μL 洗脱液,静置3 什么是期权市场的PCR指标? 分钟,12,000 rpm 4℃ 离心1分钟,收集RNA溶液。
11. -70℃保存,或直接用于下一步实验。
组份 | 50T | 100T |
吸附柱和收集管 | 各 50 个 | 各 100 个 |
裂解液 | 11mL | 22 mL |
洗涤液 A | 21mL | 42 mL |
洗涤液 B | 9 mL | 18 mL |
洗脱液 | 2.2mL | 4.4 mL |
消化液 | 1.1mL | 2.2 mL |
说明书 | 1 份 | 1 份 |
注意:1. 为防RNA酶污染,实验过程中最好戴一次性干净手套、口罩,使用处理过的无RNA酶的容器和无RNA酶的超纯水 。
2.如样本量不足200μL,请用0.85% 生理盐水补至200μL。
3.提取的RNA如暂不使用,应-70℃保存,可适当加入RNA保护因子(货号:51090,一般40μLRNA溶液加入2μL)。
本产品经严格的质量检验证明,无生物污染,注意: 本产品仅用于科研实验